根据市委编办《关于市交通运输综合行政执法改革机构编制事项的通知》，滁州交通运输综合执法支队为市交通运输局所属公益一类事业单位，副处级建制，以市交通运输局名义实行统一执法。主要职责是承担公路路政、道路运政、港口行政、航道行政、水路运政、海事行政、交通工程质量监督管理等执法门类的行政处罚，以及与行政处罚相关的行政检查、行政强制等执法职能。
        市交通运输综合行政执法支队的成立，是滁州市全面贯彻落实中央和省市深化机构改革部署的重要体现，是深化执法体制改革的一项重要举措，也是该市交通运输综合行政执法改革的一个里程碑，标志着该市交通运输执法工作进入了更加科学规范的新发展阶段。市交通运输综合执法支队将有效减少执法层级，全面整合执法队伍，大力提高执法效率，加快构建权责明晰、上下贯通、指挥顺畅、运行高效、保障有力的交通运输综合行政执法体系，为推进交通运输治理体系和治理能力现代化、加快交通运输高质量发展提供有力执法保障。